Sono attivi presso il Dipartimento, attraverso la specifica Unità Operativa, alcuni Registri Regionali di Patologia:
- Registro Regionale Mesoteliomi: in aderenza alla normativa nazionale ex art. 36 D.Lgs. 277/91, anche in Sicilia con decreto Assessoriale del 24/6/98, pubblicato sulla GURS 48 del 26/9/98, è stato istituito il Registro Regionale dei Mesoteliomi in collaborazione con il Registro Tumori di Ragusa;
- Registro Siciliano Talassemie ed Emoglobinopatie: RESTE (Registro Siciliano Talassemia ed Emoglobinopatie) operante nella Regione dal 1984;
- Registro AIDS : Aggiornamento dati regionali registro nazionale AIDS ed Epidemiologia regionale dell'infezione HIV-AIDS;
- Registro Regionale delle Malformazioni Congenite istituito con D.A. 3057 del 16/12/09.
Inoltre il Dipartimento, insieme all'Associazione Italiana Registri Tumori (AIRTum), cura il coordinamento delle attività dei Registri Tumori Siciliani.